Protein–RNA interactions for Protein: Q5SS90

Gm11992, Uncharacterized protein C7orf57 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11992Q5SS90 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm11992Q5SS90 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms