Protein–RNA interactions for Protein: Q5S248

Tmprss11e, Transmembrane protease serine 11E, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmprss11eQ5S248 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmprss11eQ5S248 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmprss11eQ5S248 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmprss11eQ5S248 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmprss11eQ5S248 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmprss11eQ5S248 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tmprss11eQ5S248 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmprss11eQ5S248 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmprss11eQ5S248 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmprss11eQ5S248 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmprss11eQ5S248 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmprss11eQ5S248 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmprss11eQ5S248 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmprss11eQ5S248 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmprss11eQ5S248 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmprss11eQ5S248 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmprss11eQ5S248 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmprss11eQ5S248 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmprss11eQ5S248 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmprss11eQ5S248 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmprss11eQ5S248 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmprss11eQ5S248 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmprss11eQ5S248 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmprss11eQ5S248 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmprss11eQ5S248 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmprss11eQ5S248 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmprss11eQ5S248 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmprss11eQ5S248 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmprss11eQ5S248 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmprss11eQ5S248 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmprss11eQ5S248 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmprss11eQ5S248 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmprss11eQ5S248 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmprss11eQ5S248 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmprss11eQ5S248 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmprss11eQ5S248 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmprss11eQ5S248 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmprss11eQ5S248 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmprss11eQ5S248 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmprss11eQ5S248 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmprss11eQ5S248 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmprss11eQ5S248 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmprss11eQ5S248 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmprss11eQ5S248 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmprss11eQ5S248 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmprss11eQ5S248 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmprss11eQ5S248 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmprss11eQ5S248 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmprss11eQ5S248 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmprss11eQ5S248 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmprss11eQ5S248 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmprss11eQ5S248 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmprss11eQ5S248 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmprss11eQ5S248 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmprss11eQ5S248 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmprss11eQ5S248 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmprss11eQ5S248 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmprss11eQ5S248 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmprss11eQ5S248 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmprss11eQ5S248 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmprss11eQ5S248 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmprss11eQ5S248 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmprss11eQ5S248 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmprss11eQ5S248 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmprss11eQ5S248 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmprss11eQ5S248 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmprss11eQ5S248 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmprss11eQ5S248 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmprss11eQ5S248 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmprss11eQ5S248 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmprss11eQ5S248 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmprss11eQ5S248 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmprss11eQ5S248 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmprss11eQ5S248 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmprss11eQ5S248 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmprss11eQ5S248 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmprss11eQ5S248 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmprss11eQ5S248 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmprss11eQ5S248 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmprss11eQ5S248 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmprss11eQ5S248 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmprss11eQ5S248 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmprss11eQ5S248 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmprss11eQ5S248 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmprss11eQ5S248 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmprss11eQ5S248 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmprss11eQ5S248 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmprss11eQ5S248 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmprss11eQ5S248 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmprss11eQ5S248 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmprss11eQ5S248 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmprss11eQ5S248 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmprss11eQ5S248 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmprss11eQ5S248 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmprss11eQ5S248 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmprss11eQ5S248 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmprss11eQ5S248 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmprss11eQ5S248 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmprss11eQ5S248 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmprss11eQ5S248 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms