Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJF7

Cacna2d4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d4Q5RJF7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacna2d4Q5RJF7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacna2d4Q5RJF7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacna2d4Q5RJF7 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna2d4Q5RJF7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms