Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trdv4Q5R1A3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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