Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Trim58Q5NCC9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trim58Q5NCC9 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trim58Q5NCC9 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trim58Q5NCC9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trim58Q5NCC9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trim58Q5NCC9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trim58Q5NCC9 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trim58Q5NCC9 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trim58Q5NCC9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trim58Q5NCC9 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trim58Q5NCC9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trim58Q5NCC9 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trim58Q5NCC9 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Trim58Q5NCC9 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trim58Q5NCC9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trim58Q5NCC9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trim58Q5NCC9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trim58Q5NCC9 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trim58Q5NCC9 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trim58Q5NCC9 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim58Q5NCC9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim58Q5NCC9 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim58Q5NCC9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim58Q5NCC9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim58Q5NCC9 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim58Q5NCC9 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim58Q5NCC9 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim58Q5NCC9 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim58Q5NCC9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim58Q5NCC9 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim58Q5NCC9 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim58Q5NCC9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim58Q5NCC9 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim58Q5NCC9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim58Q5NCC9 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim58Q5NCC9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim58Q5NCC9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim58Q5NCC9 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trim58Q5NCC9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trim58Q5NCC9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trim58Q5NCC9 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trim58Q5NCC9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trim58Q5NCC9 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trim58Q5NCC9 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Trim58Q5NCC9 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trim58Q5NCC9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trim58Q5NCC9 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trim58Q5NCC9 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trim58Q5NCC9 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trim58Q5NCC9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trim58Q5NCC9 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trim58Q5NCC9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trim58Q5NCC9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trim58Q5NCC9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trim58Q5NCC9 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trim58Q5NCC9 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trim58Q5NCC9 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trim58Q5NCC9 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trim58Q5NCC9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim58Q5NCC9 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim58Q5NCC9 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim58Q5NCC9 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim58Q5NCC9 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim58Q5NCC9 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim58Q5NCC9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim58Q5NCC9 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim58Q5NCC9 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim58Q5NCC9 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim58Q5NCC9 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim58Q5NCC9 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim58Q5NCC9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim58Q5NCC9 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim58Q5NCC9 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim58Q5NCC9 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim58Q5NCC9 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim58Q5NCC9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Trim58Q5NCC9 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Trim58Q5NCC9 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Trim58Q5NCC9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Trim58Q5NCC9 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Trim58Q5NCC9 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms