Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC83

Spata48, Spermatogenesis-associated protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata48Q5NC83 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spata48Q5NC83 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms