Protein–RNA interactions for Protein: Q5M6W3

Clhc1, Clathrin heavy chain linker domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clhc1Q5M6W3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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