Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prkaa1Q5EG47 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms