Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

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Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtl5Q5DTT4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rtl5Q5DTT4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rtl5Q5DTT4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rtl5Q5DTT4 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rtl5Q5DTT4 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rtl5Q5DTT4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
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Rtl5Q5DTT4 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rtl5Q5DTT4 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rtl5Q5DTT4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
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Rtl5Q5DTT4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rtl5Q5DTT4 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rtl5Q5DTT4 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rtl5Q5DTT4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
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Rtl5Q5DTT4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rtl5Q5DTT4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rtl5Q5DTT4 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
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Rtl5Q5DTT4 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rtl5Q5DTT4 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rtl5Q5DTT4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rtl5Q5DTT4 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rtl5Q5DTT4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
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Rtl5Q5DTT4 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rtl5Q5DTT4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rtl5Q5DTT4 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rtl5Q5DTT4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
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Rtl5Q5DTT4 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rtl5Q5DTT4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rtl5Q5DTT4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rtl5Q5DTT4 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
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Rtl5Q5DTT4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
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Rtl5Q5DTT4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rtl5Q5DTT4 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rtl5Q5DTT4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
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Rtl5Q5DTT4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
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Rtl5Q5DTT4 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rtl5Q5DTT4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
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Rtl5Q5DTT4 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rtl5Q5DTT4 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
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Rtl5Q5DTT4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rtl5Q5DTT4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rtl5Q5DTT4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rtl5Q5DTT4 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rtl5Q5DTT4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
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Rtl5Q5DTT4 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
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Rtl5Q5DTT4 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
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Rtl5Q5DTT4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rtl5Q5DTT4 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Rtl5Q5DTT4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
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Rtl5Q5DTT4 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rtl5Q5DTT4 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rtl5Q5DTT4 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rtl5Q5DTT4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rtl5Q5DTT4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rtl5Q5DTT4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rtl5Q5DTT4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rtl5Q5DTT4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rtl5Q5DTT4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rtl5Q5DTT4 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
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