Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufaf2Q59J78 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms