Protein–RNA interactions for Protein: Q569L8

Cenpj, Centromere protein J, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpjQ569L8 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CenpjQ569L8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CenpjQ569L8 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CenpjQ569L8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CenpjQ569L8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CenpjQ569L8 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CenpjQ569L8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CenpjQ569L8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CenpjQ569L8 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CenpjQ569L8 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CenpjQ569L8 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CenpjQ569L8 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CenpjQ569L8 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CenpjQ569L8 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CenpjQ569L8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CenpjQ569L8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CenpjQ569L8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CenpjQ569L8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CenpjQ569L8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CenpjQ569L8 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CenpjQ569L8 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CenpjQ569L8 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CenpjQ569L8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CenpjQ569L8 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CenpjQ569L8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CenpjQ569L8 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CenpjQ569L8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CenpjQ569L8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CenpjQ569L8 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CenpjQ569L8 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CenpjQ569L8 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CenpjQ569L8 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CenpjQ569L8 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CenpjQ569L8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CenpjQ569L8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CenpjQ569L8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CenpjQ569L8 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CenpjQ569L8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CenpjQ569L8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CenpjQ569L8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CenpjQ569L8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CenpjQ569L8 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CenpjQ569L8 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CenpjQ569L8 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CenpjQ569L8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CenpjQ569L8 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CenpjQ569L8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CenpjQ569L8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CenpjQ569L8 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CenpjQ569L8 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CenpjQ569L8 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CenpjQ569L8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CenpjQ569L8 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CenpjQ569L8 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CenpjQ569L8 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CenpjQ569L8 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CenpjQ569L8 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CenpjQ569L8 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CenpjQ569L8 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CenpjQ569L8 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CenpjQ569L8 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CenpjQ569L8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CenpjQ569L8 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CenpjQ569L8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CenpjQ569L8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CenpjQ569L8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CenpjQ569L8 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CenpjQ569L8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CenpjQ569L8 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CenpjQ569L8 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CenpjQ569L8 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CenpjQ569L8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CenpjQ569L8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CenpjQ569L8 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CenpjQ569L8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CenpjQ569L8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CenpjQ569L8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CenpjQ569L8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CenpjQ569L8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CenpjQ569L8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CenpjQ569L8 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CenpjQ569L8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CenpjQ569L8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CenpjQ569L8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CenpjQ569L8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CenpjQ569L8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CenpjQ569L8 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CenpjQ569L8 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CenpjQ569L8 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CenpjQ569L8 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CenpjQ569L8 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CenpjQ569L8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CenpjQ569L8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CenpjQ569L8 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CenpjQ569L8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CenpjQ569L8 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CenpjQ569L8 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CenpjQ569L8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CenpjQ569L8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CenpjQ569L8 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms