Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJM7

Otol1, Otolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otol1Q4ZJM7 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms