Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms