Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
H2al1nQ497L1 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
H2al1nQ497L1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
H2al1nQ497L1 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2al1nQ497L1 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2al1nQ497L1 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2al1nQ497L1 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2al1nQ497L1 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2al1nQ497L1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2al1nQ497L1 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2al1nQ497L1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms