Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1L6

Mtmr11, Myotubularin-related protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr11Q3V1L6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mtmr11Q3V1L6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms