Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0E1

Uncharacterized protein C9orf131 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3V0E1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3V0E1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3V0E1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3V0E1 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3V0E1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3V0E1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3V0E1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3V0E1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3V0E1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3V0E1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3V0E1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3V0E1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3V0E1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3V0E1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3V0E1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3V0E1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3V0E1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3V0E1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3V0E1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3V0E1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3V0E1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3V0E1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3V0E1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3V0E1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3V0E1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3V0E1 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3V0E1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3V0E1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3V0E1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3V0E1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3V0E1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3V0E1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3V0E1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3V0E1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3V0E1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3V0E1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3V0E1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3V0E1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3V0E1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3V0E1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3V0E1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3V0E1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3V0E1 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3V0E1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3V0E1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3V0E1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3V0E1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3V0E1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3V0E1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3V0E1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3V0E1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3V0E1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3V0E1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3V0E1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3V0E1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3V0E1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3V0E1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3V0E1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3V0E1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3V0E1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3V0E1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3V0E1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3V0E1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3V0E1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3V0E1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3V0E1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3V0E1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3V0E1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3V0E1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3V0E1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3V0E1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3V0E1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3V0E1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3V0E1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3V0E1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3V0E1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3V0E1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3V0E1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3V0E1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3V0E1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3V0E1 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3V0E1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3V0E1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3V0E1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3V0E1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3V0E1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3V0E1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3V0E1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3V0E1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3V0E1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3V0E1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3V0E1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3V0E1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3V0E1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3V0E1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3V0E1 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3V0E1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3V0E1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3V0E1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3V0E1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms