Protein–RNA interactions for Protein: Q3V089

Rbm44, RNA-binding protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rbm44Q3V089 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
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Rbm44Q3V089 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Rbm44Q3V089 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
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Rbm44Q3V089 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Rbm44Q3V089 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Rbm44Q3V089 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Rbm44Q3V089 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Rbm44Q3V089 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Rbm44Q3V089 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbm44Q3V089 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbm44Q3V089 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbm44Q3V089 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbm44Q3V089 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbm44Q3V089 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbm44Q3V089 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbm44Q3V089 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbm44Q3V089 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbm44Q3V089 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbm44Q3V089 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbm44Q3V089 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbm44Q3V089 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbm44Q3V089 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbm44Q3V089 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbm44Q3V089 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbm44Q3V089 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbm44Q3V089 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbm44Q3V089 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbm44Q3V089 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbm44Q3V089 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbm44Q3V089 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbm44Q3V089 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbm44Q3V089 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbm44Q3V089 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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