Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZP4

Svip, Small VCP/p97-interacting protein, mousemouse

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Length 77 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvipQ3UZP4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Olfr478-202ENSMUST00000210173 2477 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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