Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Capn13Q3UW68 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms