Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW22

Defb48, Beta-defensin 42, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb48Q3UW22 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms