Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW21

Clpsl2, Colipase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clpsl2Q3UW21 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clpsl2Q3UW21 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Clpsl2Q3UW21 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clpsl2Q3UW21 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clpsl2Q3UW21 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clpsl2Q3UW21 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clpsl2Q3UW21 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clpsl2Q3UW21 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clpsl2Q3UW21 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clpsl2Q3UW21 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clpsl2Q3UW21 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clpsl2Q3UW21 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clpsl2Q3UW21 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clpsl2Q3UW21 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clpsl2Q3UW21 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clpsl2Q3UW21 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clpsl2Q3UW21 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clpsl2Q3UW21 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clpsl2Q3UW21 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Clpsl2Q3UW21 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Clpsl2Q3UW21 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clpsl2Q3UW21 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clpsl2Q3UW21 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clpsl2Q3UW21 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Clpsl2Q3UW21 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Clpsl2Q3UW21 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clpsl2Q3UW21 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Clpsl2Q3UW21 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clpsl2Q3UW21 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clpsl2Q3UW21 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clpsl2Q3UW21 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clpsl2Q3UW21 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clpsl2Q3UW21 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clpsl2Q3UW21 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Clpsl2Q3UW21 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clpsl2Q3UW21 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clpsl2Q3UW21 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clpsl2Q3UW21 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clpsl2Q3UW21 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clpsl2Q3UW21 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clpsl2Q3UW21 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clpsl2Q3UW21 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clpsl2Q3UW21 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Clpsl2Q3UW21 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Clpsl2Q3UW21 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clpsl2Q3UW21 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Clpsl2Q3UW21 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clpsl2Q3UW21 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Clpsl2Q3UW21 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clpsl2Q3UW21 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clpsl2Q3UW21 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clpsl2Q3UW21 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clpsl2Q3UW21 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clpsl2Q3UW21 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clpsl2Q3UW21 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Clpsl2Q3UW21 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clpsl2Q3UW21 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clpsl2Q3UW21 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clpsl2Q3UW21 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clpsl2Q3UW21 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clpsl2Q3UW21 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clpsl2Q3UW21 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Clpsl2Q3UW21 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clpsl2Q3UW21 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clpsl2Q3UW21 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clpsl2Q3UW21 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clpsl2Q3UW21 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clpsl2Q3UW21 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clpsl2Q3UW21 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clpsl2Q3UW21 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Clpsl2Q3UW21 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clpsl2Q3UW21 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clpsl2Q3UW21 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clpsl2Q3UW21 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clpsl2Q3UW21 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Clpsl2Q3UW21 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clpsl2Q3UW21 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clpsl2Q3UW21 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clpsl2Q3UW21 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clpsl2Q3UW21 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clpsl2Q3UW21 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clpsl2Q3UW21 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clpsl2Q3UW21 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clpsl2Q3UW21 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clpsl2Q3UW21 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clpsl2Q3UW21 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clpsl2Q3UW21 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Clpsl2Q3UW21 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clpsl2Q3UW21 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clpsl2Q3UW21 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms