Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV66

Slfn4, Schlafen 4, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn4Q3UV66 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slfn4Q3UV66 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slfn4Q3UV66 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slfn4Q3UV66 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slfn4Q3UV66 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slfn4Q3UV66 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Slfn4Q3UV66 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slfn4Q3UV66 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slfn4Q3UV66 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slfn4Q3UV66 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slfn4Q3UV66 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slfn4Q3UV66 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slfn4Q3UV66 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slfn4Q3UV66 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slfn4Q3UV66 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slfn4Q3UV66 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slfn4Q3UV66 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slfn4Q3UV66 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slfn4Q3UV66 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slfn4Q3UV66 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slfn4Q3UV66 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slfn4Q3UV66 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slfn4Q3UV66 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slfn4Q3UV66 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slfn4Q3UV66 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slfn4Q3UV66 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Slfn4Q3UV66 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slfn4Q3UV66 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slfn4Q3UV66 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slfn4Q3UV66 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slfn4Q3UV66 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slfn4Q3UV66 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slfn4Q3UV66 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slfn4Q3UV66 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slfn4Q3UV66 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slfn4Q3UV66 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slfn4Q3UV66 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slfn4Q3UV66 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slfn4Q3UV66 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms