Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV31

Rnf223, RING finger protein 223, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf223Q3UV31 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf223Q3UV31 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf223Q3UV31 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf223Q3UV31 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf223Q3UV31 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf223Q3UV31 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf223Q3UV31 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf223Q3UV31 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf223Q3UV31 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf223Q3UV31 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf223Q3UV31 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf223Q3UV31 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf223Q3UV31 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf223Q3UV31 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf223Q3UV31 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf223Q3UV31 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf223Q3UV31 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf223Q3UV31 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf223Q3UV31 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf223Q3UV31 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf223Q3UV31 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf223Q3UV31 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf223Q3UV31 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms