Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fchsd2Q3USJ8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fchsd2Q3USJ8 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fchsd2Q3USJ8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fchsd2Q3USJ8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fchsd2Q3USJ8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fchsd2Q3USJ8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fchsd2Q3USJ8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fchsd2Q3USJ8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fchsd2Q3USJ8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fchsd2Q3USJ8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fchsd2Q3USJ8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fchsd2Q3USJ8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fchsd2Q3USJ8 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fchsd2Q3USJ8 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fchsd2Q3USJ8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Fchsd2Q3USJ8 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Fchsd2Q3USJ8 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Fchsd2Q3USJ8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fchsd2Q3USJ8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fchsd2Q3USJ8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fchsd2Q3USJ8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fchsd2Q3USJ8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fchsd2Q3USJ8 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fchsd2Q3USJ8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fchsd2Q3USJ8 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fchsd2Q3USJ8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fchsd2Q3USJ8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fchsd2Q3USJ8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fchsd2Q3USJ8 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fchsd2Q3USJ8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fchsd2Q3USJ8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fchsd2Q3USJ8 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fchsd2Q3USJ8 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fchsd2Q3USJ8 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fchsd2Q3USJ8 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fchsd2Q3USJ8 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fchsd2Q3USJ8 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fchsd2Q3USJ8 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fchsd2Q3USJ8 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fchsd2Q3USJ8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fchsd2Q3USJ8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fchsd2Q3USJ8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fchsd2Q3USJ8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fchsd2Q3USJ8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fchsd2Q3USJ8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fchsd2Q3USJ8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fchsd2Q3USJ8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fchsd2Q3USJ8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fchsd2Q3USJ8 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fchsd2Q3USJ8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fchsd2Q3USJ8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fchsd2Q3USJ8 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fchsd2Q3USJ8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Fchsd2Q3USJ8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fchsd2Q3USJ8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fchsd2Q3USJ8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fchsd2Q3USJ8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fchsd2Q3USJ8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fchsd2Q3USJ8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fchsd2Q3USJ8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fchsd2Q3USJ8 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fchsd2Q3USJ8 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fchsd2Q3USJ8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fchsd2Q3USJ8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fchsd2Q3USJ8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fchsd2Q3USJ8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fchsd2Q3USJ8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fchsd2Q3USJ8 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fchsd2Q3USJ8 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Fchsd2Q3USJ8 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fchsd2Q3USJ8 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fchsd2Q3USJ8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fchsd2Q3USJ8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fchsd2Q3USJ8 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Fchsd2Q3USJ8 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fchsd2Q3USJ8 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Fchsd2Q3USJ8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fchsd2Q3USJ8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms