Protein–RNA interactions for Protein: Q3URI6

Zfp560, Zinc finger protein 560, mousemouse

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp560Q3URI6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp560Q3URI6 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp560Q3URI6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp560Q3URI6 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp560Q3URI6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp560Q3URI6 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp560Q3URI6 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp560Q3URI6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp560Q3URI6 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp560Q3URI6 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp560Q3URI6 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp560Q3URI6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp560Q3URI6 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp560Q3URI6 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp560Q3URI6 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp560Q3URI6 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp560Q3URI6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp560Q3URI6 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp560Q3URI6 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp560Q3URI6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp560Q3URI6 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp560Q3URI6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp560Q3URI6 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp560Q3URI6 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp560Q3URI6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp560Q3URI6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp560Q3URI6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp560Q3URI6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp560Q3URI6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp560Q3URI6 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp560Q3URI6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp560Q3URI6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp560Q3URI6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp560Q3URI6 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp560Q3URI6 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp560Q3URI6 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp560Q3URI6 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp560Q3URI6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp560Q3URI6 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp560Q3URI6 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp560Q3URI6 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp560Q3URI6 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp560Q3URI6 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp560Q3URI6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp560Q3URI6 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp560Q3URI6 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp560Q3URI6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp560Q3URI6 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp560Q3URI6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp560Q3URI6 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp560Q3URI6 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp560Q3URI6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms