Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrch2Q3UMG5 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrch2Q3UMG5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrch2Q3UMG5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrch2Q3UMG5 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrch2Q3UMG5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrch2Q3UMG5 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrch2Q3UMG5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrch2Q3UMG5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrch2Q3UMG5 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrch2Q3UMG5 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrch2Q3UMG5 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrch2Q3UMG5 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrch2Q3UMG5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrch2Q3UMG5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrch2Q3UMG5 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrch2Q3UMG5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrch2Q3UMG5 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrch2Q3UMG5 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrch2Q3UMG5 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrch2Q3UMG5 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrch2Q3UMG5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrch2Q3UMG5 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrch2Q3UMG5 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrch2Q3UMG5 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrch2Q3UMG5 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrch2Q3UMG5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrch2Q3UMG5 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrch2Q3UMG5 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrch2Q3UMG5 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrch2Q3UMG5 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrch2Q3UMG5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrch2Q3UMG5 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrch2Q3UMG5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrch2Q3UMG5 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrch2Q3UMG5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrch2Q3UMG5 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrch2Q3UMG5 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrch2Q3UMG5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrch2Q3UMG5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrch2Q3UMG5 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrch2Q3UMG5 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrch2Q3UMG5 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrch2Q3UMG5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrch2Q3UMG5 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrch2Q3UMG5 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrch2Q3UMG5 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrch2Q3UMG5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrch2Q3UMG5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrch2Q3UMG5 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrch2Q3UMG5 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrch2Q3UMG5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrch2Q3UMG5 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrch2Q3UMG5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrch2Q3UMG5 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrch2Q3UMG5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrch2Q3UMG5 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrch2Q3UMG5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrch2Q3UMG5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrch2Q3UMG5 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrch2Q3UMG5 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms