Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM18

Lsg1, Large subunit GTPase 1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsg1Q3UM18 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lsg1Q3UM18 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms