Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW8

Parp3, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp3Q3ULW8 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Parp3Q3ULW8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Parp3Q3ULW8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Parp3Q3ULW8 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Parp3Q3ULW8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Parp3Q3ULW8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Parp3Q3ULW8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Parp3Q3ULW8 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Parp3Q3ULW8 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Parp3Q3ULW8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Parp3Q3ULW8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Parp3Q3ULW8 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Parp3Q3ULW8 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Parp3Q3ULW8 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Parp3Q3ULW8 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Parp3Q3ULW8 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Parp3Q3ULW8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Parp3Q3ULW8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Parp3Q3ULW8 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Parp3Q3ULW8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Parp3Q3ULW8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Parp3Q3ULW8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Parp3Q3ULW8 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Parp3Q3ULW8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Parp3Q3ULW8 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Parp3Q3ULW8 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Parp3Q3ULW8 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Parp3Q3ULW8 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Parp3Q3ULW8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Parp3Q3ULW8 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Parp3Q3ULW8 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Parp3Q3ULW8 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Parp3Q3ULW8 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Parp3Q3ULW8 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Parp3Q3ULW8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Parp3Q3ULW8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Parp3Q3ULW8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Parp3Q3ULW8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Parp3Q3ULW8 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Parp3Q3ULW8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Parp3Q3ULW8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Parp3Q3ULW8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Parp3Q3ULW8 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Parp3Q3ULW8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Parp3Q3ULW8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Parp3Q3ULW8 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Parp3Q3ULW8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Parp3Q3ULW8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Parp3Q3ULW8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Parp3Q3ULW8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Parp3Q3ULW8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Parp3Q3ULW8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Parp3Q3ULW8 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Parp3Q3ULW8 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Parp3Q3ULW8 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Parp3Q3ULW8 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Parp3Q3ULW8 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Parp3Q3ULW8 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Parp3Q3ULW8 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Parp3Q3ULW8 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Parp3Q3ULW8 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Parp3Q3ULW8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Parp3Q3ULW8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Parp3Q3ULW8 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Parp3Q3ULW8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Parp3Q3ULW8 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Parp3Q3ULW8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Parp3Q3ULW8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Parp3Q3ULW8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Parp3Q3ULW8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Parp3Q3ULW8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Parp3Q3ULW8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Parp3Q3ULW8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Parp3Q3ULW8 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Parp3Q3ULW8 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Parp3Q3ULW8 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Parp3Q3ULW8 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Parp3Q3ULW8 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Parp3Q3ULW8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Parp3Q3ULW8 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Parp3Q3ULW8 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Parp3Q3ULW8 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Parp3Q3ULW8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Parp3Q3ULW8 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Parp3Q3ULW8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Parp3Q3ULW8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Parp3Q3ULW8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Parp3Q3ULW8 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Parp3Q3ULW8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Parp3Q3ULW8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Parp3Q3ULW8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Parp3Q3ULW8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Parp3Q3ULW8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Parp3Q3ULW8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Parp3Q3ULW8 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms