Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf224Q3UIW8 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms