Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHJ8

Rnf44, RING finger protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf44Q3UHJ8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf44Q3UHJ8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf44Q3UHJ8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf44Q3UHJ8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf44Q3UHJ8 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf44Q3UHJ8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf44Q3UHJ8 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf44Q3UHJ8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf44Q3UHJ8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf44Q3UHJ8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf44Q3UHJ8 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf44Q3UHJ8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf44Q3UHJ8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf44Q3UHJ8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf44Q3UHJ8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf44Q3UHJ8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf44Q3UHJ8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf44Q3UHJ8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf44Q3UHJ8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf44Q3UHJ8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf44Q3UHJ8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf44Q3UHJ8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf44Q3UHJ8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf44Q3UHJ8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf44Q3UHJ8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf44Q3UHJ8 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf44Q3UHJ8 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf44Q3UHJ8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf44Q3UHJ8 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf44Q3UHJ8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf44Q3UHJ8 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf44Q3UHJ8 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf44Q3UHJ8 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf44Q3UHJ8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf44Q3UHJ8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf44Q3UHJ8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf44Q3UHJ8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf44Q3UHJ8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf44Q3UHJ8 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf44Q3UHJ8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf44Q3UHJ8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf44Q3UHJ8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf44Q3UHJ8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf44Q3UHJ8 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf44Q3UHJ8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf44Q3UHJ8 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf44Q3UHJ8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf44Q3UHJ8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf44Q3UHJ8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf44Q3UHJ8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf44Q3UHJ8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf44Q3UHJ8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf44Q3UHJ8 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf44Q3UHJ8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf44Q3UHJ8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf44Q3UHJ8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf44Q3UHJ8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf44Q3UHJ8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf44Q3UHJ8 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf44Q3UHJ8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf44Q3UHJ8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf44Q3UHJ8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf44Q3UHJ8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf44Q3UHJ8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf44Q3UHJ8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf44Q3UHJ8 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf44Q3UHJ8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf44Q3UHJ8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf44Q3UHJ8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf44Q3UHJ8 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf44Q3UHJ8 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf44Q3UHJ8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf44Q3UHJ8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf44Q3UHJ8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf44Q3UHJ8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf44Q3UHJ8 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf44Q3UHJ8 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf44Q3UHJ8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf44Q3UHJ8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf44Q3UHJ8 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf44Q3UHJ8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf44Q3UHJ8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf44Q3UHJ8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf44Q3UHJ8 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf44Q3UHJ8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf44Q3UHJ8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf44Q3UHJ8 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf44Q3UHJ8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf44Q3UHJ8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf44Q3UHJ8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf44Q3UHJ8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf44Q3UHJ8 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf44Q3UHJ8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms