Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHF3

Mier3, Mesoderm induction early response protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mier3Q3UHF3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mier3Q3UHF3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms