Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFS0

Zyg11b, Protein zyg-11 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zyg11bQ3UFS0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Zyg11bQ3UFS0 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zyg11bQ3UFS0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zyg11bQ3UFS0 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zyg11bQ3UFS0 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zyg11bQ3UFS0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zyg11bQ3UFS0 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zyg11bQ3UFS0 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zyg11bQ3UFS0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zyg11bQ3UFS0 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zyg11bQ3UFS0 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zyg11bQ3UFS0 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zyg11bQ3UFS0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zyg11bQ3UFS0 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zyg11bQ3UFS0 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zyg11bQ3UFS0 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zyg11bQ3UFS0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zyg11bQ3UFS0 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zyg11bQ3UFS0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zyg11bQ3UFS0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zyg11bQ3UFS0 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zyg11bQ3UFS0 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zyg11bQ3UFS0 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zyg11bQ3UFS0 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zyg11bQ3UFS0 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zyg11bQ3UFS0 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zyg11bQ3UFS0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zyg11bQ3UFS0 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Zyg11bQ3UFS0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zyg11bQ3UFS0 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zyg11bQ3UFS0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zyg11bQ3UFS0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zyg11bQ3UFS0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zyg11bQ3UFS0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zyg11bQ3UFS0 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zyg11bQ3UFS0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zyg11bQ3UFS0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zyg11bQ3UFS0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms