Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Puf60Q3UEB3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Puf60Q3UEB3 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Puf60Q3UEB3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Puf60Q3UEB3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Puf60Q3UEB3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Puf60Q3UEB3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Puf60Q3UEB3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Puf60Q3UEB3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Puf60Q3UEB3 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Puf60Q3UEB3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Puf60Q3UEB3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Puf60Q3UEB3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Puf60Q3UEB3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Puf60Q3UEB3 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Puf60Q3UEB3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Puf60Q3UEB3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Puf60Q3UEB3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Puf60Q3UEB3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Puf60Q3UEB3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Puf60Q3UEB3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Puf60Q3UEB3 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Puf60Q3UEB3 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Puf60Q3UEB3 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Puf60Q3UEB3 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Puf60Q3UEB3 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Puf60Q3UEB3 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Puf60Q3UEB3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Puf60Q3UEB3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Puf60Q3UEB3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Puf60Q3UEB3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Puf60Q3UEB3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Puf60Q3UEB3 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Puf60Q3UEB3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Puf60Q3UEB3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Puf60Q3UEB3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Puf60Q3UEB3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Puf60Q3UEB3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Puf60Q3UEB3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Puf60Q3UEB3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Puf60Q3UEB3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Puf60Q3UEB3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms