Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms