Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms