Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2P1

Sec24a, Protein transport protein Sec24A, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec24aQ3U2P1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec24aQ3U2P1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec24aQ3U2P1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec24aQ3U2P1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec24aQ3U2P1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec24aQ3U2P1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec24aQ3U2P1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec24aQ3U2P1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec24aQ3U2P1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec24aQ3U2P1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec24aQ3U2P1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec24aQ3U2P1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec24aQ3U2P1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec24aQ3U2P1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec24aQ3U2P1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec24aQ3U2P1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec24aQ3U2P1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec24aQ3U2P1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec24aQ3U2P1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec24aQ3U2P1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec24aQ3U2P1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec24aQ3U2P1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec24aQ3U2P1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec24aQ3U2P1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec24aQ3U2P1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec24aQ3U2P1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec24aQ3U2P1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec24aQ3U2P1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec24aQ3U2P1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec24aQ3U2P1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec24aQ3U2P1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec24aQ3U2P1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec24aQ3U2P1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec24aQ3U2P1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec24aQ3U2P1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec24aQ3U2P1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec24aQ3U2P1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec24aQ3U2P1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec24aQ3U2P1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec24aQ3U2P1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec24aQ3U2P1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec24aQ3U2P1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec24aQ3U2P1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec24aQ3U2P1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec24aQ3U2P1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec24aQ3U2P1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec24aQ3U2P1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec24aQ3U2P1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec24aQ3U2P1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec24aQ3U2P1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec24aQ3U2P1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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