Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms