Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms