Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms