Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX8

Rufy4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy4Q3TYX8 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms