Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms