Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccdc136Q3TVA9 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccdc136Q3TVA9 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccdc136Q3TVA9 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccdc136Q3TVA9 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccdc136Q3TVA9 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccdc136Q3TVA9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccdc136Q3TVA9 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccdc136Q3TVA9 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccdc136Q3TVA9 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccdc136Q3TVA9 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccdc136Q3TVA9 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccdc136Q3TVA9 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccdc136Q3TVA9 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccdc136Q3TVA9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccdc136Q3TVA9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccdc136Q3TVA9 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccdc136Q3TVA9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccdc136Q3TVA9 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccdc136Q3TVA9 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccdc136Q3TVA9 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccdc136Q3TVA9 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccdc136Q3TVA9 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccdc136Q3TVA9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccdc136Q3TVA9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccdc136Q3TVA9 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccdc136Q3TVA9 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccdc136Q3TVA9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccdc136Q3TVA9 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccdc136Q3TVA9 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccdc136Q3TVA9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc136Q3TVA9 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc136Q3TVA9 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc136Q3TVA9 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc136Q3TVA9 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc136Q3TVA9 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc136Q3TVA9 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc136Q3TVA9 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc136Q3TVA9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc136Q3TVA9 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccdc136Q3TVA9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccdc136Q3TVA9 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccdc136Q3TVA9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccdc136Q3TVA9 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccdc136Q3TVA9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccdc136Q3TVA9 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccdc136Q3TVA9 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccdc136Q3TVA9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccdc136Q3TVA9 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccdc136Q3TVA9 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccdc136Q3TVA9 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccdc136Q3TVA9 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccdc136Q3TVA9 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccdc136Q3TVA9 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccdc136Q3TVA9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccdc136Q3TVA9 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccdc136Q3TVA9 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccdc136Q3TVA9 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccdc136Q3TVA9 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccdc136Q3TVA9 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccdc136Q3TVA9 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccdc136Q3TVA9 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccdc136Q3TVA9 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccdc136Q3TVA9 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccdc136Q3TVA9 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccdc136Q3TVA9 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccdc136Q3TVA9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccdc136Q3TVA9 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccdc136Q3TVA9 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccdc136Q3TVA9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccdc136Q3TVA9 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccdc136Q3TVA9 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccdc136Q3TVA9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccdc136Q3TVA9 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccdc136Q3TVA9 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccdc136Q3TVA9 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccdc136Q3TVA9 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ccdc136Q3TVA9 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ccdc136Q3TVA9 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ccdc136Q3TVA9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ccdc136Q3TVA9 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ccdc136Q3TVA9 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ccdc136Q3TVA9 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ccdc136Q3TVA9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ccdc136Q3TVA9 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc136Q3TVA9 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc136Q3TVA9 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc136Q3TVA9 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc136Q3TVA9 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc136Q3TVA9 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc136Q3TVA9 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc136Q3TVA9 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc136Q3TVA9 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc136Q3TVA9 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc136Q3TVA9 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc136Q3TVA9 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc136Q3TVA9 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc136Q3TVA9 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc136Q3TVA9 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc136Q3TVA9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms