Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q3TTJ4 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Q3TTJ4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q3TTJ4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q3TTJ4 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q3TTJ4 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q3TTJ4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q3TTJ4 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q3TTJ4 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3TTJ4 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3TTJ4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3TTJ4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3TTJ4 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3TTJ4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3TTJ4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3TTJ4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3TTJ4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3TTJ4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3TTJ4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3TTJ4 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3TTJ4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3TTJ4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3TTJ4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3TTJ4 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3TTJ4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3TTJ4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3TTJ4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3TTJ4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms