Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTD8

Gm21440, Predicted gene, 20737, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21440Q3TTD8 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21440Q3TTD8 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21440Q3TTD8 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21440Q3TTD8 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21440Q3TTD8 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21440Q3TTD8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21440Q3TTD8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21440Q3TTD8 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21440Q3TTD8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21440Q3TTD8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21440Q3TTD8 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm21440Q3TTD8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm21440Q3TTD8 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm21440Q3TTD8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm21440Q3TTD8 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21440Q3TTD8 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21440Q3TTD8 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21440Q3TTD8 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21440Q3TTD8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21440Q3TTD8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21440Q3TTD8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21440Q3TTD8 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21440Q3TTD8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21440Q3TTD8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21440Q3TTD8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21440Q3TTD8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21440Q3TTD8 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21440Q3TTD8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21440Q3TTD8 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21440Q3TTD8 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21440Q3TTD8 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21440Q3TTD8 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21440Q3TTD8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21440Q3TTD8 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21440Q3TTD8 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21440Q3TTD8 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21440Q3TTD8 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Gm21440Q3TTD8 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21440Q3TTD8 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21440Q3TTD8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21440Q3TTD8 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21440Q3TTD8 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21440Q3TTD8 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21440Q3TTD8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21440Q3TTD8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21440Q3TTD8 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21440Q3TTD8 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21440Q3TTD8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21440Q3TTD8 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21440Q3TTD8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21440Q3TTD8 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Gm21440Q3TTD8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21440Q3TTD8 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21440Q3TTD8 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21440Q3TTD8 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21440Q3TTD8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21440Q3TTD8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21440Q3TTD8 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21440Q3TTD8 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Gm21440Q3TTD8 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21440Q3TTD8 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21440Q3TTD8 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21440Q3TTD8 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21440Q3TTD8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21440Q3TTD8 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21440Q3TTD8 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21440Q3TTD8 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21440Q3TTD8 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21440Q3TTD8 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21440Q3TTD8 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21440Q3TTD8 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21440Q3TTD8 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21440Q3TTD8 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21440Q3TTD8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21440Q3TTD8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21440Q3TTD8 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21440Q3TTD8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21440Q3TTD8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21440Q3TTD8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21440Q3TTD8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21440Q3TTD8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21440Q3TTD8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21440Q3TTD8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21440Q3TTD8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21440Q3TTD8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21440Q3TTD8 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21440Q3TTD8 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21440Q3TTD8 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms