Protein–RNA interactions for Protein: Q3TSA9

Fbxw18, Expressed sequence C85627, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxw18Q3TSA9 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms