Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQQ9

Uncharacterized protein C1orf112 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 903 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TQQ9 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q3TQQ9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q3TQQ9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q3TQQ9 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q3TQQ9 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q3TQQ9 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q3TQQ9 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q3TQQ9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3TQQ9 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3TQQ9 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3TQQ9 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3TQQ9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3TQQ9 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3TQQ9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3TQQ9 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3TQQ9 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3TQQ9 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3TQQ9 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3TQQ9 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3TQQ9 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3TQQ9 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3TQQ9 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3TQQ9 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3TQQ9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3TQQ9 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3TQQ9 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3TQQ9 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3TQQ9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3TQQ9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3TQQ9 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3TQQ9 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q3TQQ9 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q3TQQ9 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q3TQQ9 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q3TQQ9 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q3TQQ9 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q3TQQ9 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q3TQQ9 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q3TQQ9 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q3TQQ9 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q3TQQ9 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q3TQQ9 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q3TQQ9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q3TQQ9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q3TQQ9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q3TQQ9 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q3TQQ9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q3TQQ9 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q3TQQ9 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q3TQQ9 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q3TQQ9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q3TQQ9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q3TQQ9 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q3TQQ9 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q3TQQ9 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q3TQQ9 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q3TQQ9 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q3TQQ9 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q3TQQ9 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q3TQQ9 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Q3TQQ9 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Q3TQQ9 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q3TQQ9 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q3TQQ9 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q3TQQ9 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q3TQQ9 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q3TQQ9 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q3TQQ9 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q3TQQ9 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q3TQQ9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q3TQQ9 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q3TQQ9 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q3TQQ9 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q3TQQ9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Q3TQQ9 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q3TQQ9 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q3TQQ9 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q3TQQ9 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q3TQQ9 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q3TQQ9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q3TQQ9 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q3TQQ9 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q3TQQ9 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q3TQQ9 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q3TQQ9 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q3TQQ9 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q3TQQ9 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q3TQQ9 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q3TQQ9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q3TQQ9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q3TQQ9 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q3TQQ9 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q3TQQ9 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q3TQQ9 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q3TQQ9 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q3TQQ9 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q3TQQ9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q3TQQ9 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q3TQQ9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q3TQQ9 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72 ms