Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP8

Tmem38a, Trimeric intracellular cation channel type A, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem38aQ3TMP8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem38aQ3TMP8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms