Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gtf3c3Q3TMP1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms