Protein–RNA interactions for Protein: Q1ERP8

Cd300lg, CMRF35-like molecule 9, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lgQ1ERP8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd300lgQ1ERP8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd300lgQ1ERP8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd300lgQ1ERP8 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd300lgQ1ERP8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd300lgQ1ERP8 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd300lgQ1ERP8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd300lgQ1ERP8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd300lgQ1ERP8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd300lgQ1ERP8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd300lgQ1ERP8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd300lgQ1ERP8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd300lgQ1ERP8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd300lgQ1ERP8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd300lgQ1ERP8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd300lgQ1ERP8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd300lgQ1ERP8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd300lgQ1ERP8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd300lgQ1ERP8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd300lgQ1ERP8 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd300lgQ1ERP8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd300lgQ1ERP8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd300lgQ1ERP8 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd300lgQ1ERP8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd300lgQ1ERP8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd300lgQ1ERP8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd300lgQ1ERP8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd300lgQ1ERP8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd300lgQ1ERP8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd300lgQ1ERP8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd300lgQ1ERP8 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd300lgQ1ERP8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd300lgQ1ERP8 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd300lgQ1ERP8 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd300lgQ1ERP8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd300lgQ1ERP8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd300lgQ1ERP8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd300lgQ1ERP8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd300lgQ1ERP8 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd300lgQ1ERP8 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd300lgQ1ERP8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd300lgQ1ERP8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd300lgQ1ERP8 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd300lgQ1ERP8 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd300lgQ1ERP8 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd300lgQ1ERP8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd300lgQ1ERP8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd300lgQ1ERP8 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd300lgQ1ERP8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd300lgQ1ERP8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd300lgQ1ERP8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd300lgQ1ERP8 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd300lgQ1ERP8 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd300lgQ1ERP8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd300lgQ1ERP8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd300lgQ1ERP8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd300lgQ1ERP8 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd300lgQ1ERP8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd300lgQ1ERP8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cd300lgQ1ERP8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cd300lgQ1ERP8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cd300lgQ1ERP8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Cd300lgQ1ERP8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cd300lgQ1ERP8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cd300lgQ1ERP8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cd300lgQ1ERP8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cd300lgQ1ERP8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cd300lgQ1ERP8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd300lgQ1ERP8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd300lgQ1ERP8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd300lgQ1ERP8 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd300lgQ1ERP8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd300lgQ1ERP8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd300lgQ1ERP8 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd300lgQ1ERP8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd300lgQ1ERP8 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd300lgQ1ERP8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd300lgQ1ERP8 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd300lgQ1ERP8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd300lgQ1ERP8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd300lgQ1ERP8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd300lgQ1ERP8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd300lgQ1ERP8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd300lgQ1ERP8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd300lgQ1ERP8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd300lgQ1ERP8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd300lgQ1ERP8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd300lgQ1ERP8 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd300lgQ1ERP8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd300lgQ1ERP8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd300lgQ1ERP8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd300lgQ1ERP8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd300lgQ1ERP8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd300lgQ1ERP8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd300lgQ1ERP8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd300lgQ1ERP8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd300lgQ1ERP8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd300lgQ1ERP8 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd300lgQ1ERP8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd300lgQ1ERP8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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