Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ptcd3Q14C51 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ptcd3Q14C51 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ptcd3Q14C51 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ptcd3Q14C51 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ptcd3Q14C51 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptcd3Q14C51 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptcd3Q14C51 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptcd3Q14C51 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptcd3Q14C51 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptcd3Q14C51 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptcd3Q14C51 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptcd3Q14C51 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptcd3Q14C51 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptcd3Q14C51 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptcd3Q14C51 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptcd3Q14C51 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptcd3Q14C51 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptcd3Q14C51 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptcd3Q14C51 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptcd3Q14C51 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptcd3Q14C51 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptcd3Q14C51 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptcd3Q14C51 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptcd3Q14C51 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptcd3Q14C51 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptcd3Q14C51 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptcd3Q14C51 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptcd3Q14C51 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptcd3Q14C51 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptcd3Q14C51 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptcd3Q14C51 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptcd3Q14C51 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptcd3Q14C51 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptcd3Q14C51 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptcd3Q14C51 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptcd3Q14C51 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptcd3Q14C51 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptcd3Q14C51 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptcd3Q14C51 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptcd3Q14C51 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptcd3Q14C51 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptcd3Q14C51 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptcd3Q14C51 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptcd3Q14C51 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptcd3Q14C51 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptcd3Q14C51 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptcd3Q14C51 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptcd3Q14C51 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptcd3Q14C51 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptcd3Q14C51 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptcd3Q14C51 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptcd3Q14C51 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptcd3Q14C51 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptcd3Q14C51 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptcd3Q14C51 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptcd3Q14C51 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptcd3Q14C51 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptcd3Q14C51 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptcd3Q14C51 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptcd3Q14C51 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptcd3Q14C51 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptcd3Q14C51 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptcd3Q14C51 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptcd3Q14C51 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptcd3Q14C51 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptcd3Q14C51 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptcd3Q14C51 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptcd3Q14C51 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptcd3Q14C51 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptcd3Q14C51 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptcd3Q14C51 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptcd3Q14C51 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptcd3Q14C51 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptcd3Q14C51 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptcd3Q14C51 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptcd3Q14C51 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ptcd3Q14C51 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ptcd3Q14C51 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ptcd3Q14C51 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ptcd3Q14C51 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ptcd3Q14C51 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ptcd3Q14C51 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ptcd3Q14C51 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ptcd3Q14C51 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ptcd3Q14C51 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ptcd3Q14C51 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ptcd3Q14C51 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ptcd3Q14C51 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ptcd3Q14C51 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ptcd3Q14C51 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ptcd3Q14C51 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ptcd3Q14C51 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ptcd3Q14C51 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ptcd3Q14C51 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms